В соответствии с Регламентом ФОНБЕТ-Первенства России по футболу, по итогам сезона-2016/17 состав Футбольной Национальной Лиги должны пополнить пять победителей турниров Профессиональной футбольной лиги и две команды Премьер-Лиги, занявшие 15-е и 16-е места.

Кроме того, состав ФНЛ на следующий сезон может измениться после переходных матчей между клубами РФПЛ и ФНЛ 25 и 28 мая 2017 года. Право на участие в них от нашей лиги завоевали «Енисей» и «СКА-Хабаровск», которые сыграют с 14-й и 13-й командами РФПЛ, соответственно.

По итогам Росгосстрах Чемпионата России из Премьер-Лиги выбыли «Томь» и «Крылья Советов».

Среди клубов ПФЛ три футбольный клуба гарантировали себе первые места досрочно – «Чита» в группе «Восток», питерское «Динамо» в группе «Запад» и курский «Авангард» в группе «Центр».

Вместе с тем, «Томь» и «Чита» не получили лицензию на следующий спортивный сезон: томичи ожидают решения Апелляционного комитета РФС по вопросам лицензирования, а читинцы и вовсе не стали проходить обязательную процедуру лицензирования для участия в Первенстве.

Согласно пункту 4.11 и пункту 4.14 Регламента ФОНБЕТ-Первенства России по футболу, преимущественным правом на замену клубов РФПЛ и ПФЛ, не получивших лицензию, обладает клуб ФНЛ, выбывший из состава участников по итогам первенства и имеющий лицензию для участия в первенстве следующего спортивного сезона.

В настоящий момент, в числе клубов ФНЛ, выбывших по итогам прошедшего спортивного сезона и имеющих лицензию для участия в Первенстве следующего сезона, значатся «Мордовия», «Сокол», «Спартак-Нальчик» и «Нефтехимик». Три клуба ФНЛ - «Факел», «Луч-Энергия» и «Кубань» - вместе с упомянутой выше «Томью» ожидают решения Апелляционного комитета РФС по вопросам лицензирования, заседание которого состоится 30 мая.

Необходимые лицензии из клубов ПФЛ, уже гарантировавших и еще только претендующих на повышение в классе, получили нижегородский «Олимпиец», «Динамо СПб», «Ротор-Волгоград», «Зенит-Ижевск», курский «Авангард» и «Армавир».

Согласно пункту 4.14 Регламента ФОНБЕТ-Первенства России по футболу, клубы ПФЛ, занявшие по итогам предыдущего спортивного сезона в Первенстве России по футболу среди команд клубов ПФЛ вторые места в своих зонах и получившие лицензию на право участия в первенстве следующего спортивного сезона, получают право на замену клуба ПФЛ или клуба ФНЛ, не получившего лицензию на право участия в первенстве следующего спортивного сезона, только после отказа от такого права клубов ФНЛ, выбывших из состава участников по итогам первенства и имеющих лицензию для участия в первенстве следующего спортивного сезона.